Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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