Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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