Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncapd3Q6ZQK0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms