Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssxb10Q6XAR7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssxb10Q6XAR7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ssxb10Q6XAR7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ssxb10Q6XAR7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb10Q6XAR7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ssxb10Q6XAR7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms