Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtifQ6PEE2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms