Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms