Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sarm1Q6PDS3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sarm1Q6PDS3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms