Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mfsd13aQ6PDE8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms