Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Soga3Q6NZL0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Soga3Q6NZL0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms