Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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KdsrQ6GV12 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KdsrQ6GV12 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms