Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms