Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms