Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp9bQ66X22 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp9bQ66X22 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms