Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
BC080695Q66JY9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
BC080695Q66JY9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms