Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms