Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScxQ64124 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScxQ64124 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms