Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab34Q64008 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab34Q64008 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms