Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcncQ62447 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcncQ62447 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcncQ62447 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms