Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms