Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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