Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sprr1bQ62267 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms