Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm5dQ62240 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm5dQ62240 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms