Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ssr4Q62186 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssr4Q62186 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssr4Q62186 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssr4Q62186 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ssr4Q62186 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssr4Q62186 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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