Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx3xQ62167 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms