Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga6Q61739 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms