Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms