Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samhd1Q60710 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samhd1Q60710 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms