Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Psmb6Q60692 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb6Q60692 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms