Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms