Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms