Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vps41Q5KU39 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms