Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Rtl5Q5DTT4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rtl5Q5DTT4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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