Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f8Q58FA4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms