Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrig2Q52KR2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms