Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdp2Q504M2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdp2Q504M2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms