Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Xirp2Q4U4S6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms