Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Snhg11Q4G0K9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Snhg11Q4G0K9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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