Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxn3Q499D0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms