Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ulk4Q3V129 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms