Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc43Q3V0L5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms