Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms