Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TceancQ3US16 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TceancQ3US16 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TceancQ3US16 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TceancQ3US16 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TceancQ3US16 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms