Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms