Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms