Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upf3bQ3ULL6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Upf3bQ3ULL6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms