Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdhd2Q3UGR5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdhd2Q3UGR5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms