Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fam35aQ3UEN2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms