Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trafd1Q3UDK1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms