Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccndbp1Q3TVC7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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