Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms